《癌细胞》
卵巢癌免疫原性受一小部分记忆T细胞亚群控制
美国莫菲特癌症研究中心Jose R. Conejo-Garcia研究揭示，卵巢癌免疫原性受一小部分祖组织驻留记忆T细胞亚群的控制。相关论文近日发表于《癌细胞》。
他们报告说，卵巢癌浸润性T细胞中肿瘤识别的标志主要局限于组织驻留记忆（TRM）细胞。83454个CD3+CD8+CD103+CD69+TRM细胞的单细胞RNA/TCR/ATAC测序和122种高级别浆液性卵巢癌的免疫组织化学显示，只有祖（TCF1low）组织驻留T细胞（TRMstem细胞），但不循环TCF1+T细胞，预测卵巢癌结果。TRM干细胞源自过渡循环T细胞，这依赖于抗原亲和力/持久性。因此，卵巢癌确实是一种免疫原性疾病，但这取决于约13%的CD8+肿瘤浸润性T细胞（约3%的CD8+克隆型），这些细胞针对高亲和力抗原启动并维持效应TRM样细胞波动。
该结果定义了人类卵巢癌中相关肿瘤反应性细胞特征，这可能适用于其他具有不理想突变负担的肿瘤。
相关论文信息：
https://doi.org/10.1016/j.ccell.2022.03.008
《自然》
哺乳动物体细胞突变率随寿命延长而变化
近日，英国威康桑格研究所的研究人员发现，哺乳动物体细胞突变率随寿命延长而变化。相关论文日前在线发表于《自然》。
研究人员对56名个体的208个肠道隐窝进行了全基因组测序来揭示16个哺乳动物物种的体细胞突变情况，发现体细胞突变在所有物种中都被看似内源性的突变过程所主导。其他物种的突变特征与人类描述的相似，但每年的体细胞突变率在不同的物种中差异很大，并与物种的寿命呈反比，所研究的其他生命史特征没有类似关联。尽管这些物种之间的生活史有很大不同，但寿命结束时的体细胞突变负担仅有3倍左右的差异。这些数据揭示了整个哺乳动物的共同突变过程，并表明体细胞突变率在演化上受到限制，可能是衰老的一个促成因素。
相关论文信息：
https://doi.org/10.1038/s41586-022-04618-z
《自然—生物技术》
碱基编辑器评估人类癌症相关突变
韩国首尔延世大学医学院Hyongbum Henry Kim团队利用碱基编辑器对人类癌症相关突变进行了高通量功能评估。日前，研究成果在线发表于《自然—生物技术》。
研究人员使用胞嘧啶和腺嘌呤碱基编辑器以及单导向RNA（sgRNA）文库，评估了29060种癌症相关过渡突变（这些突变会导致蛋白质变异）对非致瘤性肺细胞的存活和增殖的功能影响。通过使用与慢病毒递送构建体上的sgRNA编码序列配对的替代靶序列监测碱基编辑效率和结果，研究人员确定了sgRNA诱导产生的单个主要蛋白质变体，从而能将这些突变与碱基编辑引起的细胞表型联系起来。绝大多数蛋白质变体（28458个变体，98%）的功能被归类为中性或可能中性；只有18个（0.06%）和157个（0.5%）变体分别导致生长和可能生长的表型。
研究人员希望他们的方法可以扩展到更多未知意义的变体和其他肿瘤类型中。
相关论文信息：
https://doi.org/10.1038/s41587-022-01276-4
肿瘤论文哺乳动物
